Menú
La verificación de la Flow Cell se utiliza para evaluar el número de nanoporos disponibles en la Flow Cell. Debe realizarse cuando esté listo para usar la Flow Cell, y dentro de los 3 meses posteriores a la compra (excepto para las Flow Cells de Flongle, que actualmente tienen una vida útil de cuatro semanas).
Oxford Nanopore Technologies reemplazará cualquier Flow Cell que caiga por debajo del número garantizado de poros activos, siempre que el resultado se informe dentro de los dos días posteriores a la realización de la verificación de la Flow Cell y se hayan seguido las recomendaciones de almacenamiento.
| Flow cell | Número mínimo de poros activos cubiertos por la garantía |
|---|---|
| Flongle Flow Cell (FLO-FLG001) | 50 |
| Flongle Flow Cell (FLO-FLGOP1) | 30 |
| MinION/GridION Flow Cell | 800 |
| PromethION Flow Cell | 5000 |
Recomendamos almacenar las Flow Cells sin abrir, de la siguiente manera:
| Flow cell | Instrucciones de almacenamiento |
|---|---|
| Flongle Flow Cells | 2–8°C durante 4 semanas |
| MinION/GridION Flow Cells | temperatura ambiente durante un mes, o a 2–8°C durante 12 semanas |
| PromethION Flow Cells | 2–8°C por 12 semanas |
En este paso, utilizarás el software MinKNOW para verificar el número de poros en tu celda de flujo. Esto debe hacerse antes de cargar tu biblioteca de ADN o ARN en la celda de flujo.
Las celdas de flujo se envían con una molécula de ADN de control de calidad presente en el buffer. Esta molécula produce una señal distintiva de nanoporo. El software MinKNOW™ utiliza esta señal para validar la integridad del conjunto de nanoporos antes de su uso y proporciona al usuario una estimación del número de canales disponibles simultáneamente para el experimento.
1) Abre la tapa del MinION Mk1B/GridION e inserta la Celda de Flujo del MinION.
Inserta la celda de flujo en el MinION Mk1B/GridION deslizando la celda de flujo debajo del clip. Presiona firmemente sobre la celda de flujo para asegurar un buen contacto térmico y eléctrico.
2) Conecta el MinION Mk1B y la celda de flujo ensamblada a la computadora principal.
Una vez conectado correctamente, verás una luz y escucharás el ventilador.
3) Haz doble clic en el ícono de MinKNOW ubicado en el escritorio para abrir la interfaz de usuario de MinKNOW.
4) Recomendamos a los usuarios iniciar sesión en el software de MinKNOW utilizando sus credenciales de la Comunidad.
Para iniciar sesión, debes estar conectado a Internet.
Desde aquí, también puedes cambiar el idioma en la interfaz de usuario en la esquina inferior derecha.
Se te pedirá que ingreses tu dirección de correo electrónico y contraseña de Nanopore:
Si experimentas problemas para iniciar sesión, visita el canal de Soporte de la Comunidad (https://community.nanoporetech.com/support) y utiliza «Continuar como invitado» para un uso temporal.
5) Haz clic en el dispositivo de secuenciación conectado a la computadora.
La Visión General de Secuenciación debería mostrar que la celda de flujo no ha tenido ningún chequeo realizado.
A continuación se muestra un ejemplo de un dispositivo GridION con un Flongle insertado en la posición X1 y celdas de flujo MinION en las posiciones X2 – X5.
6) Navega a la página de inicio y haz clic en ‘Verificar celda de flujo’.
7) Cuando veas que se reconocen el tipo de celda de flujo y los identificadores de celda de flujo, haz clic en ‘Iniciar’ para comenzar.
Serás automáticamente dirigido a la página de Visión General de Secuenciación.
Aparecerá una barra de carga debajo de la celda de flujo durante los chequeos.
Este ejemplo es un CTC de Flongle (barra de carga resaltada en rojo).
La verificación de la celda de flujo debería tomar unos minutos.
Indicadores de estado de la celda de flujo
La calidad de la celda de flujo se mostrará como uno de los tres resultados:
